Le microbiome intestinal pourrait être la « boîte noire » de la recherche en nutrition

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Dans un récent article publié dans la revue Cell, des chercheurs de l’Université d’Alberta, au Canada, et de l’University College Cork, en Irlande, ont analysé les directives nutritionnelles actuelles concernant le microbiote intestinal.

Contexte

Le régime alimentaire joue un rôle essentiel dans la santé humaine et la pathogenèse des maladies chroniques non transmissibles au niveau épidémique. L’augmentation constante des maladies chroniques parmi les populations de pays non industrialisés qui adoptent un régime alimentaire de type occidental est un témoignage frappant de l’influence substantielle de l’alimentation sur la santé humaine.

Les conseils diététiques fondés sur des données probantes sont essentiels à la promotion de la santé, compte tenu de l’épidémie mondiale de maladies chroniques associées à l’alimentation.

Bien que le microbiote intestinal humain joue un rôle important dans les conséquences physiologiques de l’alimentation et la genèse des maladies chroniques, les recommandations diététiques dans le monde commencent seulement à tirer parti des avancées scientifiques dans le domaine du microbiome.

Les études à l’intersection du microbiome et des disciplines de la nutrition se sont développées récemment. Néanmoins, les liens entre l’alimentation, le microbiome et l’hôte ont fait l’objet de peu d’attention dans les directives diététiques actuelles.

A propos de l’étude

Dans la présente étude, les chercheurs ont abordé les recommandations nutritionnelles actuelles du point de vue de la science du microbiome, en se concentrant sur les résultats qui ont révélé les interactions hôte-microbe comme moteurs des impacts physiologiques de l’alimentation.

Les scientifiques ont limité leurs discussions aux directives alimentaires basées sur l’alimentation pour la promotion de la santé et la prévention des maladies auprès du grand public, ce qui est l’objectif de ces directives.

L’équipe s’est concentrée sur les études qui ont montré comment le microbiote intestinal régule et facilite les effets physiologiques des composés alimentaires, des habitudes alimentaires et de certains aliments. Ils ont utilisé leurs résultats pour aider à clarifier les débats sur la nutrition, créer des conseils nutritionnels innovants et fournir un paradigme expérimental pour intégrer le microbiome dans la recherche sur la nutrition.

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Interactions entre le microbiote intestinal et les aliments recommandés

Les auteurs ont constaté que les recommandations alimentaires de nombreux pays aux traditions alimentaires diverses présentent un haut niveau de cohérence.

Ces directives étaient en accord avec d’autres grandes plateformes nutritionnelles, comme la Commission EAT-Lancet sur les régimes alimentaires sains et les systèmes alimentaires durables et la Harvard T.H. Chan School of Public Health.

Toutes les recommandations diététiques préconisent les aliments végétaux entiers tels que les fruits, les légumes, les légumineuses, les céréales complètes et les fruits à coque plutôt que les aliments transformés contenant du sel, des graisses saturées ou du sucre. Les fibres alimentaires et les composés phytochimiques sont deux éléments essentiels des aliments végétaux complets.

Les éléments rapidement fermentescibles contenus dans les aliments transformés peuvent induire une croissance excessive des bactéries dans l’intestin grêle et un profil métabolique et de composition microbienne indésirable. En outre, ils ont un impact négatif sur les systèmes immunitaire et endocrinien.

Les éléments prouvant la capacité des céréales complètes à réduire la probabilité de maladies chroniques étaient solides. La fonction des bactéries intestinales dans ces effets était de plus en plus étudiée. Selon une étude combinant des recherches sur l’homme et des évaluations mécanistiques sur des souris, le microbiote pourrait jouer un rôle causal dans les effets des céréales complètes sur la santé.

Plusieurs normes alimentaires recommandent de consommer fréquemment des aliments riches en protéines d’origine végétale en raison de leurs avantages pour la santé humaine et planétaire. Des études de plus en plus nombreuses indiquent que le microbiome intestinal joue probablement un rôle dans les bienfaits des légumineuses pour la santé.

En outre, des preuves solides issues d’études d’observation et d’intervention montrent qu’une consommation importante de poissons gras a un effet cardioprotecteur, et la flore intestinale pourrait être le médiateur de ces avantages pour la santé.

Régime méditerranéen

Le régime méditerranéen comprend de nombreux aliments qui ont un impact favorable sur les interactions avec l’hôte.

Il conseille les fruits, les légumes, les légumineuses, les fruits à coque, les céréales complètes et l’huile d’olive comme aliments essentiels, une consommation modérée d’œufs, de volaille, de poisson et de produits laitiers, et une consommation limitée de viandes rouges et d’aliments transformés.

De nombreuses études récentes sur le microbiome confirment la place prépondérante du régime méditerranéen dans les recommandations diététiques.

En effet, les recommandations diététiques récemment mises à jour préconisent des habitudes alimentaires qui reflètent le régime méditerranéen, telles que les approches diététiques pour stopper l’hypertension (DASH).

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Connexions régime alimentaire-microbe-hôte sur la question controversée de l’alimentation saine

Des considérations toxicologiques expliquent la classification des risques des viandes rouges et transformées par l’Organisation mondiale de la santé (OMS) ou le groupe d’experts du Centre international de recherche sur le cancer (CIRC), ainsi que les recommandations diététiques existantes, sur la base de corrélations dose-réponse probables.

En outre, de nombreux modèles mécanistes sur animaux soulignent les effets potentiellement néfastes des graisses saturées dérivées du lait sur l’homéostasie du microbiote, ce qui renforce les recommandations diététiques visant à limiter la consommation de produits laitiers riches en graisses.

Il n’est pas certain que le microbiote contribue de manière causale aux conséquences métaboliques aiguës des régimes pauvres en glucides et en graisses chez l’homme. Les auteurs ont noté que l’utilisation de techniques ciblées sur le microbiote pour améliorer les régimes à faible teneur en glucides pourrait être bénéfique.

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Impact du microbiome intestinal sur l’évolution des recommandations nutritionnelles

L’équipe a déclaré que les recommandations diététiques, les approches nutritionnelles ciblées et le développement de produits alimentaires pour combattre le risque de maladies chroniques pourraient bénéficier de la prise en compte de la façon dont les interactions entre le régime alimentaire et le microbiome influencent la physiologie humaine. Elle a également préparé le terrain pour des initiatives visant à restaurer le microbiome. La technique de restauration du microbiome pourrait être réalisée en théorie avec des synbiotiques et des probiotiques alimentaires.

On a émis l’hypothèse que la reformulation des aliments transformés, plutôt que leur éradication, permettrait d’améliorer la qualité du régime alimentaire à l’échelle mondiale. De tels efforts nécessiteront une percée dans le domaine de l’ingénierie alimentaire pour traiter les interconnexions entre l’alimentation, les microbes et les hôtes.

Les chercheurs ont mentionné que les stratégies nutritionnelles pourraient être utilisées pour cibler le microbiome et les taxons bénéfiques pour la santé une fois leurs caractéristiques reconnues. Les évaluations du microbiome sont un élément essentiel des méthodes de nutrition de précision axées sur la prévention et le traitement des maladies chroniques, entre autres aspects spécifiques à l’individu, en raison de la réaction hautement personnalisée du microbiote intestinal au régime alimentaire.

Cadre expérimental intégrant le microbiome intestinal aux recherches sur la nutrition

Les données sur les relations entre l’alimentation, le microbiome et l’hôte pourraient améliorer, modifier et innover les recommandations diététiques.

L’intégration du microbiome intestinal dans les recommandations diététiques doit s’appuyer sur des preuves de la contribution causale et mécaniste du microbiome aux effets physiologiques de l’alimentation.

L’équipe s’est référée à d’excellentes études qui définissent des normes de bonnes pratiques pour les études sur le microbiome intestinal et les a complétées par un plan expérimental à trois piliers intégrant le microbiome intestinal dans toutes les phases de la recherche en nutrition. Parmi ces piliers figurent :

  • La découverte du microbiome pour développer des hypothèses sur une alimentation saine,
  • L’intégration du microbiome dans les études d’intervention sur l’homme,
  • La compréhension mécaniste et les déductions causales concernant la fonction du microbiome dans les impacts du régime alimentaire.

Conclusions

Selon les auteurs, la convergence des concepts fondamentaux dans les secteurs de la nutrition et du microbiome confirme les recommandations diététiques actuelles. Ils ont découvert que l’intégration systématique des connaissances sur le microbiome dans les études sur la nutrition peut stimuler et révolutionner davantage le concept d’alimentation saine.

Dans l’ensemble, les résultats de l’étude indiquent que le régime alimentaire est lié de manière significative à l’absence ou à la présence de maladies, qui sont ensuite reliées au microbiome. Les liens entre l’alimentation et le microbiome devraient contribuer à l’étude des fondements moléculaires des effets physiologiques de l’alimentation, faisant du microbiome intestinal la « boîte noire » des études nutritionnelles. Il existe une justification biologique et évolutive convaincante pour que les deux disciplines étendent leurs collaborations déjà importantes et persistantes afin d’en apprendre davantage sur la manière d’améliorer la santé par le biais de l’alimentation.

Les chercheurs ont déclaré que les critères d’évaluation centrés sur le microbiome doivent être intégrés dans toutes les facettes de la science de la nutrition afin d’accroître la base scientifique des recommandations alimentaires. En outre, la recherche en microbiologie nutritionnelle peut fournir des informations complètes sur tous les éléments d’une alimentation saine. Elle contribue ainsi à solutionner la question de la prévention et du contrôle des maladies basées sur l’alimentation.

Via Gut microbiome may be the « black box » of nutrition research

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